Aluminium w szczepionkach od lat jest najbardziej kontrowersyjnym dodatkiem. Zwolennicy szczepień twierdzą, że jest to malutka, a bardzo potrzebna dawka. Przeciwnicy zaś uważają że nawet tak małe dawki tej neurotoksyny potrafią zniszczyć zdrowie dziecka. Dwa ostatnie badania określały ekspozycję na aluminium i możliwe problemy z bezpieczeństwem, które wynikają z przestrzegania aktualnego harmonogramu szczepień pediatrycznych CDC. Aluminium (Al) "nadwyręża" siateczki endoplazmatyczne, organelle odpowiedzialne za biosyntezę lipidów, magazynowanie wapnia oraz składanie i przetwarzanie białek; znajdują się one w większości komórek w organizmie. Stres retikulum endoplazmatycznego może wywoływać reakcję niesfałdowanych białek i prowadzić do chorób autoimmunologicznych i neurotoksyczności. Aluminium upośledza również funkcje mitochondriów i aparatu Golgiego w nerkach, co zmniejsza zdolność organizmu do wydalania metalu. Związki glinu, takie jak oksywodorotlenek glinu i hydroksyfosforan glinu, są stosowane w niektórych szczepionkach w celu pobudzenia odpowiedzi immunologicznej na antygen szczepionkowy. W swoim badaniu z 2018 roku James Lyons-Weiler i Robert Ricketson piszą: "Dawkowanie aluminium w szczepionkach opiera się na wytwarzaniu miana przeciwciał, a nie na nauce o bezpieczeństwie". Dopuszczona granica dawki aluminium dla dorosłych wynosi 850 μg Al/dawkę. W 2011 roku Wspólny Komitet Ekspertów ds. Dodatków do Żywności ustalił tymczasowe tolerowane tygodniowe spożycie aluminium na poziomie 2000 μg Al/kg masy ciała, na podstawie badań przeprowadzonych na dorosłych gryzoniach. Agencja Rejestru Substancji Toksycznych i Chorób (Agency for Toxic Substances and Disease Registry) stosuje 1000 μg Al/kg jako "minimalny poziom ryzyka". Te wytyczne dotyczą spożywanego aluminium, znajdującego się w żywności i wodzie, a nie aluminium wstrzykiwanego. Eksperymenty na zwierzętach pokazują, że spożyte aluminium jest wchłaniane w znacznie mniejszym stopniu niż aluminium wstrzyknięte. Jedyne wytyczne bezpieczeństwa dla aluminium podawanego w zastrzykach dotyczą osób z zaburzeniami czynności nerek i wynoszą 4-5 μg Al/kg/dzień. A przecież wiele wcześniaków ma upośledzoną czynność nerek. Lyons-Weiler i Ricketson zastosowali zasadę Clarka do tych wytycznych. Reguła Clarka jest używana do oceny dawki pediatrycznej, w oparciu o wagę dziecka, gdy dostępne są tylko zalecenia dla dorosłych. Szczepionka Hep B, którą CDC zaleca podawać wszystkim noworodkom, zawiera 250 μg Al, czyli 17 razy więcej aluminium niż byłoby dozwolone, gdyby dawka została dostosowana do masy ciała zgodnie z zasadą Clarka. Lyons-Weiler jest autorem badania z 2020 roku, które porównuje ekspozycję na aluminium szczepionkowe i szacowaną przewlekłą retencję aluminium spowodowaną przez trzy różne harmonogramy szczepień: harmonogram CDC, harmonogram CDC przy stosowaniu dostępnych szczepionek o niskiej zawartości aluminium lub bez aluminium oraz „Plan przyjazny szczepieniom” pediatry Paula Thomasa z Oregonu. Autorzy wykorzystali model Priesta do oszacowania klirensu aluminium. Priest wstrzyknął dorosłemu mężczyźnie pojedynczą dawkę rozpuszczalnego izotopu glinu i wykonywał okresowe pomiary spektrometrii masowej przez 12 lat. Model Priest nie może oczywiście dostarczyć bezpośrednich informacji o klirensie Al u niemowląt, które ważą znacznie mniej niż osoba dorosła i których współczynnik przesączania kłębuszkowego nerek (GFR) jest mniejszy niż u dorosłych. GFR dzieci osiąga poziom dorosłych dopiero w wieku około dwóch lat. Jak wyjaśniają autorzy badania, model Priesta jest zbyt optymistyczny, jeśli chodzi o usuwanie aluminium w przypadku małych dzieci. Nie uwzględnia wagi dziecka, czynności nerek, zmian genetycznych, które mogą wpływać na klirens glinu, ani synergistycznej toksyczności z fluorem, rtęcią lub innymi toksycznymi metalami w środowisku. Jest to jednak wszystko, czym obecnie dysponuje medycyna akademicka. Korzystając z równania Priesta, jeśli szczepionka Hep B jest podawana po urodzeniu (zgodnie z zalecanymi przez CDC), od 8 do 12 procent z 250 μg Al w tej szczepionce pozostaje w organizmie, gdy dziecko otrzyma następny zestaw zalecanych przez CDC szczepionek po dwóch miesiącach. Harmonogram CDC w wieku dwóch miesięcy składa się z drugiej dawki HepB (250 μg Al), DTaP (błonnica-tężec-krztusiec; 625 μg Al) Hib (Haemophilus influenae typ b; 225 μg Al) i PVC13 (koniugat pneumokokowy; 125 μg Al), w sumie 1225 μg aluminium. Od 8% do 12% tej sumy będzie w organizmie, gdy niemowlę otrzyma więcej szczepionek w wieku czterech miesięcy. Zmodyfikowany schemat CDC wykorzystuje szczepionkę DTaP o niskiej zawartości aluminium (330 μg Al) i ActHib, która nie zawiera aluminium - co daje łącznie 705 μg Al dla tych samych czterech szczepionek. (Oprócz tych szczepionek zawierających glin, CDC zaleca rotawirusa i inaktywowane szczepionki przeciwko polio w wieku 2 miesięcy.) Dr. Thomas nie zaleca szczepionki przeciwko wirusowemu zapaleniu wątroby typu B dla dzieci, których matki nie są zakażone wirusem. W wieku dwóch miesięcy zaleca niskoaluminiowy DTaP i ActHib (bez aluminium). W wieku czterech miesięcy dzieci zgodnie z harmonogramem CDC otrzymują kolejną dawkę DTaP, Hib i PVC13. CDC zaleca dawki przypominające HepB, DTaP i PVC13 w wieku sześciu miesięcy, Hib, PVC13 i pierwszą dawkę HepA (250 μg Al) po 12 miesiącach oraz kolejną dawkę DTaP i HepA po 18 miesiącach. Zgodnie z harmonogramem szczepień CDC, dzieci otrzymują 4925 μg aluminium do 18 miesiąca życia, w porównaniu do 3037 μg Al w zmodyfikowanym harmonogramie i 1820 μg Al w harmonogramie dr Thomasa. Korzystając z równania Priesta, 4% aluminium z tej pierwszej szczepionki HepB pozostaje gdzieś w tkance ciała dziecka dwa lata później. Biorąc pod uwagę regularne wprowadzanie większej liczby szczepionek zawierających aluminium w ciągu pierwszych 18 miesięcy życia, łatwo zauważyć, że usuwanie aluminium i możliwa toksyczność mogą być problemem dla małych dzieci. Autorzy analizy "zdecydowanie zalecają, aby amerykańska FDA zaktualizowała swój modus operandi w celu uwzględnienia danych z badań nad wstrzykiwanymi formami aluminium u myszy niemowląt oraz aby FDA ustanowiła miesięczne limity ekspozycji na aluminium ze wszystkich źródeł, w tym 1 lub więcej [szczepionek zawierających aluminium] podawanych w tym samym miesiącu".
